حوزه/ حضرت آیت الله صافی گلپایگانی در پیام تسلیتی فقدان روحانی وارسته علامه سید جعفر عاملی را برای مراکز علمی و دینی خسارت دانستند.
حوزه/ علامه محقق مرتضی عاملی از علاقهمندان و دوستداران انقلاب اسلامی و ارادتمندان امام خمینی (ره) و مقام معظم رهبری «مدظله العالی» بود که با تدوین آثار تحقیقاتی فراوان و ارائه تاریخ صحیح اسلام و مذهب حقه جعفری، فصل جدیدی در این رشتهی علمی و تاریخنگاری اسلام گشود.
در پی ارتحال آیتالله علامه سیدجعفر مرتضی العاملی(ره)، پیام تسلیتی از سوی آیتالله علیاکبر رشاد، رییس شورای حوزههای علمیه استان تهران و مؤسس و رییس پژوهشگاه فرهنگ و اندیشهی اسلامی صادر شد.
خطیب نماز جمعه تهران گفت: این سخن که "عدهای بر تعامل سازنده با دنیا و عدهای بر تقابل مستمر با جهان تاکید دارند"، قرین انصاف نیست. اینجانب یک چهره عالم، متعهد و سیاستمدار را نمیشناسم که معتقد به تقابل مستمر با جهان در مقابل نگاه تعامل سازنده با دنیا باشد. چگونه در نهاد علم و دانشگاه این سخن قابل طرح است؟.
همزمان با پنجمین سالگرد ارتحال آیت الله مهدی کنی مراسم تجدید میثاق با این عالم ربانی بر سر مزار وی با حضور شخصیت های دینی، و لشکری و کشوری برپا شد.